Сан-Марино по своему государственному устройству — республика. В стране действует конституция, одобренная Большим генеральным советом 8 октября 1600 г. В конституцию были внесены изменения решением общего собрания глав семейств 26 марта 1906 г., а позже рядом указов Большого генерального совета.
Верховная власть принадлежит Большому генеральному совету (однопалатному парламенту), который состоит из 60 депутатов. Депутаты должны быть не моложе 25 лет и являться гражданами Сан-Марино. Срок их полномочий — 4 года. По избирательному закону 1873 г. право выбирать имеют все граждане Сан-Марино, достигшие 21 года. Большой генеральный совет является законодательным органом: он издает законы, утверждает договоры и соглашения назначает чиновников и офицеров на должности, обладает правом на амнистию, предоставляет гражданство, все почетные титулы и ордена, контролирует госбюджет и назначает из своей среды капитанов-регентов, являющихся фактически высшей государственной и исполнительной властью в республике. Большой генеральный совет назначает также из своего состава правительство Сан-Марино, в том числе двух государственных секретарей по иностранным и внутренним делам.
Капитаны-регенты, или консулы, выполняют функции главы государства. Они избираются Большим генеральным советом на шесть месяцев (с 1 апреля до 1 октября и с 1 октября до 1 апреля каждого года). Один из них должен жить в деревне и заниматься сельским трудом, другой — в городе. Капитаны-регенты обязательно должны быть гражданами Сан-Марино по рождению. Действуют капитаны-регенты совместно. Чтобы их решения исполнялись, они должны быть согласованными, поскольку регенты обладают правом «вето» по отношению друг к другу. Такое же право они имеют и на решения Большого генерального совета. По истечении срока полномочий капитаны-регенты могут быть избраны вторично на эту должность только через три года. Должность капитанов-регентов — это почетная обязанность, за которую они не получают зарплаты. По старой традиции Большой генеральный совет выдвигает кандидатуры шести человек, которые баллотируются на пост капитанов-регентов. Записки с этими именами бросаются в урну, и ребенок вытаскивает две записки. В правительственном дворце новые капитаны-регенты клянутся на Евангелии защищать республику и соблюдать конституцию, после чего от своих предшественников они получают высший символ власти — цепи рыцарского ордена Сан-Марино. В конце своего пребывания в должности капитаны-регенты обязаны выступить с отчетом о своей деятельности, причем каждый гражданин Сан-Марино может публично огласить жалобу на то или иное несправедливое, по его мнению, действие капитанов-регентов.
Исполнительная власть осуществляется капитанами-регентами совместно с Государственным конгрессом, который состоит из десяти членов, избираемых Большим генеральным советом из числа его членов на весь срок полномочий парламента.
До сих пор в Сан-Марино сохранился любопытный государственный институт — «аренго» — ассамблея глав семейств, созываемая для обсуждения общественных дел. Этот институт еще в XIII в. отдал все свои полномочия Большому генеральному совету и только в начале XX в. вернул себе некоторые из них. Как считают сами санмаринцы, «аренго» — это гарант демократическо-республиканской структуры общества и государства: он выполняет функции сената.
К государственным органам относится также «Совет 12-ти», который был создан еще в XV в. Он назначается коллегией Большого генерального совета и фактически выполняет функции Верховного суда. Все тюремные заключения свыше шести месяцев отбываются в итальянских тюрьмах, хотя осужденные остаются арестованными властями Сан-Марино.
В административном отношении Сан-Марино разделено на 12 округов, или, как их здесь называют, «замков».
Во время торжественного открытия нового правительственного дворца 30 сентября 1894 г. по решению Большого генерального совета впервые был исполнен национальный гимн, созданный известным флорентийским музыкантом Федерико Консоло. Во время своих занятий в библиотеке св. Лаурента во Флоренции Консоло нашел в монашеском требнике старый хорал X в. и переработал его.